1. Perbedaan fungsional
Inkubator biokimia tidak memiliki kontrol kelembaban dan fungsi antivirus, sedangkan inkubator jamur memiliki fungsi kontrol kelembaban dan antivirus. Oleh karena itu, inkubator cetakan dengan volume yang sama sedikit lebih mahal daripada inkubator biokimia. Inkubator cetakan dilengkapi dengan lampu sterilisasi, sedangkan inkubator biokimia tidak perlu dipasang. Inkubator cetakan tersedia dengan atau tanpa pelembapan, sedangkan inkubator biokimia tidak memiliki pilihan pelembapan. Mereka semua dapat digunakan untuk kultur bakteri. Jika kultur bakteri tidak memerlukan pendinginan, inkubator suhu konstan pemanas listrik juga dapat dipilih.
2. Perbedaan penggunaan
Inkubator biokimia banyak digunakan dalam kultur dan pengawetan bakteri, jamur, mikroorganisme, sel jaringan, serta analisis kualitas air dan pengujian BOD, cocok untuk eksperimen pemuliaan dan budidaya tanaman. Ini adalah peralatan eksperimental penting untuk lembaga penelitian ilmiah, perguruan tinggi dan universitas, unit produksi atau laboratorium departemen dalam biologi, rekayasa genetika, kedokteran, kesehatan dan pencegahan epidemi, perlindungan lingkungan, pertanian, kehutanan dan peternakan.
Inkubator kapang adalah peralatan eksperimen yang cocok untuk membudidayakan mikroorganisme eukariotik seperti kapang. Karena sebagian besar kapang cocok untuk tumbuh pada suhu kamar (25 °C), dan perlu menjaga kelembaban tertentu saat dikultur pada substrat padat. Oleh karena itu, inkubator cetakan umum terdiri dari sistem pendingin, sistem pemanas, pelembab udara dan ruang budidaya, sirkuit kontrol dan panel operasi. Serta menggunakan sensor suhu dan sensor kelembaban untuk menjaga kestabilan suhu dan kelembaban di ruang budidaya. Beberapa inkubator cetakan khusus juga dapat mengatur suhu dan kelembaban untuk berubah seiring waktu inkubasi.